Lolium perenne (ペレニアル ライグラス) は、世界中の温帯地域で最も広く栽培されている牧草およびアメニティ グラス種であり、より広範な環境サービスを提供する主要な農業形質と作物特性の遺伝的構造を理解する必要があります。 ハーパー ら. は、細菌人工染色体 (BAC) ベースの物理マップをゲノムワイド関連研究 (GWAS) と統合することにより、農業上重要な形質に関連するゲノム領域を特定することを目的としていました。
使用したソフトウェアと確率しきい値に応じて、約 3600 から 7500 の物理マップ コンティグが導出され、約 35 のシーケンスされた BAC クローンと統合され、 L. ペレンヌ ゲノム。 GWAS から、XNUMX つの異なる遺伝子座が出穂日、植物の幅、植物のバイオマス、および水溶性炭水化物の蓄積と有意に関連しており、そのうち XNUMX つが物理的な地図のコンティグに関連している可能性がありました。 これにより、多数の候補遺伝子の同定が可能になりました。
物理マッピング リソースを GWAS と組み合わせることで、候補遺伝子の検索をより広い領域にわたって拡張することができました。 L. ペレンヌ ゲノムといくつかの興味深い遺伝子モデルの注釈を特定しました。 これらの物理マップは、将来のシーケンスベースのアセンブリの検証に役立ちます L. ペレンヌ ゲノム。
