Botany 2020で提供されたいくつかのインタラクティブなワークショップのXNUMXつは、北米のデジタル植物相（正式名称はメキシコ北部、略してFNA）に関するもので、ベータ版で入手できます。 こちらワークショップは、プロジェクトの紹介と、セマンティック検索や分類群リストの形での情報出力にプロジェクトを使用するための入門書として機能しました。私たちの多くは、30 年以来 1993 巻に及ぶ膨大なシリーズである FNA の印刷版をよく知っています。このシリーズは、現在までに 21 巻が出版されています。完成すると、このプロジェクトは、シノニム、識別キー、説明、範囲、イラストなどを含め、世界全体の約 20,000% にあたる 7 種以上の植物種を扱うことになります。
しかし、印刷された植物図鑑の弱点は、グループに関する科学的理解が変化すると、すぐに時代遅れになってしまうことです。たとえば、シダの分類は、FNA の出版が始まって以来、すでに大きく変化しています。そこで登場したのが、最新の状態を維持するために必要に応じて更新できる検索可能なリポジトリである FNA Online です。私は、カナダ農業食品省の生物多様性データ マネージャーであり、ワークショップのファシリテーターでもあるジョセリン ペンダー氏に、FNA Online プロジェクトの目標と課題について話を聞きました。
このプロジェクトの主要目標は2つあり、最新の情報を提供し続けることと、分類学的記述を人間と機械の両方が容易に検索できるようにすることでユーザーベースを拡大することです。「植物相の未来はデジタル化され、データ中心になると信じています」とペンダー氏は述べています。「私たちはこれを念頭に置いてFNAオンラインを構築しています。FNAの有用性を、従来の専門植物学者や分類学者といったユーザーグループから、教育者、市民科学者、趣味の植物学者、規制当局、政策立案者、園芸家、農学者、生態学者、分子生物学者、系統学者などを含む、より広範なユーザーグループへと広げたいと考えています。これは、ユーザーがコンテンツとインタラクションできる方法を増やすことを意味します。私たちのビジョンには、複数の専門レベルに対応したインタラクティブなキー、規制当局や教育者向けのオンザフライチェックリスト、生態学者や分子生物学者向けのダウンロード可能な分類群-形質マトリックスなどが含まれています。」
デジタル FNA の作成者が直面している大きな課題は、多くの異なる著者によって自然言語で書かれた分類学的記述を機械可読にして、簡単に検索および比較できるようにすることです。自然言語の使用、特に分類学的記述のいくつかの側面により、これは困難な作業となっています。
まず、著者はそれぞれ独自の記述スタイルを持ち、異なる語彙を使用します。「解析されたコンテンツを複数の処理間で比較できるようにするという課題に直面しています」とペンダー氏は説明します。「ある著者が花びらを「フクシア」と記述し、別の著者が「栗色と赤褐色」と記述した場合、ユーザーが花びらの色を「赤」でフィルタリングできるインタラクティブなキーを開発するにはどうすればよいでしょうか。私たちは用語の同義語を開発するために懸命に取り組んできましたが、これは手間がかかり、人為的ミスや誤った推論が起こりがちです。」
植物学の言語の複雑さも、もう 1 つのハードルです。「1 つの用語が、2 つの科で 2 つの重複しない独自の意味を持つことがあります」とペンダー氏は言います。「さらに、複雑なグループの中には、植物学者の間で言葉の意味について強い合意がないものもあります。最後に、分類学上の説明では、電信的なサブ言語の特定のスタイルが使用され、人間が簡単に挿入できる重要でない単語が省略されます。機械は、フレーズやアイデアを結び付ける推論を行うのに苦労します。」
これらの理由やその他の理由により、言語パーサーは「ジャンク」を生成します。これは、回避が難しく、検索機能を完全に動作させるために対処する必要がある、意味のない名前や値の出力です。現在までに、デジタル植物相の背後にあるチームは、FNA の出版されたすべての巻のすべての説明を解析しましたが、データの「クリーンさ」と構成を改善するためにまだ取り組んでいます。カナダのチームも、専用のオンライン フローラ オブ カナダを構築中です。ペンダー氏はこれを「標本データ、発生データ、さまざまなソースからの解析された特性データを統合した、進化するデータ マッシュアップ製品」と想定しています。
FNAオンラインベータ版を試してみたい場合は、サイトで ガイド さまざまなクエリと出力タイプを作成するためのものです。Pender 氏は、さまざまなユーザーがこれを試してみることを期待しています。「私たちがまだ想像していないユーザー グループやユース ケースが出現することを期待しています。」
