ボブ・オールキン氏へのインタビュー：植物の名前と用途の複雑な絡み合いを解き明かす方法とは？

あなたはどんな名前で呼ばれていますか？どこに行ってもみんな同じ名前で呼ばれますか？おそらくそうではないでしょう。植物についても同じことが言えます。植物につける名前は、植物との関係、用途、生育場所、そして植物が持つ性質によって異なります。植物のこうした文化的側面は、特定の植物を探し求めることや、庭に生えた新しい植物を観察することなど、自然とつながるためのシンプルな方法です。しかし、植物の一般的な名前は、しばしば誤解を招いたり、他の植物の一般的な名前と重複したりすることがあります。これは、「メイフラワー」を探しているときに問題となることがあります。エピガエア・レペンス) あなたの友人は「メイフラワー」を考えています (カルダミン・プラテンシス）そしてあなたのもう一人の友人は「メイフラワー」を考えています（クラテグスlaevigata).

植物について効果的に伝えるには、正確な命名が鍵となります。命名に関する不一致に関連するいくつかの問題を理解するために、Botany Oneはインタビューを行いました。 ボブ・オールキン博士プログラムマネージャー 植物利用情報学 キュー王立植物園のチームによるインタビューです。このインタビューは、分かりやすさと簡潔さを考慮して編集されています。

あなたはキャリアの大部分をキュー王立植物園で過ごし、分類学、生物多様性情報学、そして有用な植物知識の交わる分野で研究されてきました。これまでのキャリアの歩みと、デジタル植物学に関わるようになった経緯について少しお聞かせいただけますか？

多くの人がキャリアの中で経験することだと思いますが、私の場合はほとんど偶然と機会主義的なものでした。学校では生物学を全く勉強していませんでしたが、大学で生物学を学びたいと思い、海洋生物学に興味を持ちました。クイーン・メアリー・カレッジのコースに登録しました。そこでは、さまざまな分野のコースを自由に組み合わせることができました。生物学を全く勉強したことがなかったので、ついていけるか不安でした。そこで、生物学に加えて数学、コンピューター、化学もいくつか履修し、最終的に複合優等学位を取得しました。2年目と3年目は生物学に集中しましたが、数学は得意だったので、難なくこなせました。それが自然史博物館で博士号を取得するきっかけとなりました。博士課程での私の課題は、コンピューターを使って識別ツールを構築する方法を改善することでした。

何世紀にもわたり、植物学者や動物学者は識別キーを作成してきましたが、これは実質的には決定木であり、情報を整理する上で非常に効率の悪い方法です。例えば、最初の質問が「この植物には白い花か赤い花か？」で、観察している植物に花がない場合、この方法は実際には機能しません。これらのシステムの目的は、植物や昆虫を識別しようとしている人とコンピューターとの間のやり取りを円滑にし、「花の色はわからないけれど、根はこんな感じだし、私はフランスにいる。次に何を調べればいいのだろう？」といったように、ユーザーが質問できるようにすることでした。

私の研究は、より数学的かつ論理的なものでした。それは、そのような識別システムを機能させるために、優れた診断特性、あるいは特性のセットとは何かという点に焦点を当てたものでした。その後、メキシコに行きました。そこで流暢に別の言語を話せるようになり、人々が他の言語では異なる考え方をしていることに気づいたので、人生が変わりました。私はメキシコ、そしてラテンアメリカ全般に魅了されました。これまで取り組んできたのと同じツールを使って、私は小さなチームを結成し、 ある州の植物データセット：ベラクルス州. 

私は学生や植物標本館の職員が、少なくとも科や属レベルまで植物を識別できるツールを提供したいと考えていました。しかし、その過程で、それがどれほど難しいことかを痛感しました。これらのツールは植物を識別する人の作業を容易にするために設計されたものでしたが、専門の植物学者が自分の情報をこれらの形式に変換するには膨大な労力が必要でした。データの保存形式があまりにもひどかったため、実際には誰も利用していませんでした。そこで私はデータ構造にますます興味を持つようになったのです。 

それがきっかけで、私はサウサンプトン大学でポスドクとして働き、そこで私たちは当初 Vicieae のデータベース [現在はFabeae族]は、エンドウ、レンズ豆、レンリソウなどを含むマメ科植物の族です。既存のソフトウェアを使用して、これらの植物の化学、地理、形態の観点から、450種すべてについてこれが可能であることを示しました。そのVicieaeプロジェクトはその後、マメ科植物全体を対象とした国際コンソーシアムとなり、最終的には 国際マメ科植物データベースおよび情報サービスある意味、これが私が初めて、私たちのユーザーが誰で、私たちに何を求めているのかを考え始めたきっかけでした。植物学者が、植物学者以外の人が実際にどのような情報に興味を持ち、その情報をどのように表現してほしいと考えているのかを理解しようとしない姿勢に、私は不満を感じ、今でもその不満は変わりません。

データベースを構築するのは、言うまでもなく大変な作業です。私がメキシコで行った研究に基づいた最初の論文は、データの多様な利用方法に関するものでした。データベースを一つの目的、一つの対象者だけのために構築するなんて、馬鹿げています。しかし、データを使って様々なことをしたいという欲求、そしてそれがデータの保存方法や使用する言葉にも影響を与えるという事実が、十分に理解されていないように思います。

祖母が理解できる植物の識別ガイドを作成する例を挙げると分かりやすいでしょう。祖母は居間にポインセチアを置いていました。祖母にとっては赤い花が咲いているのですが、植物学者は当然、赤い花は苞葉であり、花自体は小さくて白いので、赤い花ではないと言うでしょう。このように、植物には2つの異なる解釈があり、識別ガイドが本来の目的を果たすためには、その点を認識し、情報をどのように保存するかを考える必要があります。

私は国際開発省（DFID）で技術協力担当官として働く機会に恵まれました。ブラジル北東部で5年以上、地域社会におけるプログラム運営に携わり、農村開発と、そこに住む人々の生活を向上させるために何ができるかを検討しました。私が赴任した地域では、私たちのNGOパートナーが既に広く知られており、植物に関する知識は豊富だが読み書きのできない農家の人々とワークショップを開催していました。そこで私たちは、視覚的な表現を駆使し、小石や植物を使うなど、さまざまな方法で彼らと交流を図りました。彼らに情報ニーズの優先順位を尋ねたところ、薬用植物が常に上位か2位に挙がりました。薬用植物以外では、長い乾季のヤギの飼料が挙げられました。このことから、私たちのコミュニケーションがうまくいっていないことが明らかになりました。科学や研究は、現場の人々が理解できる方法で伝えられてこそ意味を持つものです。ですから、私たちがもっと注力すべきはまさにそこだと私は考えています。それは結局、人間的な側面、つまり人々と実際に話し合い、決めつけるのではなく、彼らが何をしようとしているのかを理解することに行き着く。 

あなたは、有用植物、薬用植物、世界的な植物データベースなど、植物情報の整理と標準化に向けた主要な取り組みに携わってこられました。これらのプロジェクトを通して、現在の植物データ基盤の長所と短所について、どのようなことを学びましたか？

素晴らしい新技術の世界には、数多くの成功事例があります。博士号取得後、私はこうしたコンピュータ支援による植物識別ツールが本当に機能するのか非常に懐疑的でした。種の多様性ではなく、データの不足が問題だと考えていたからです。私の頭の中では、植物識別を始める前に、あらゆる植物の完全な記述を含むビッグデータマトリックスが必要だと考えていました。しかし今では、スマートフォンの植物識別アプリを使えば、写真を撮るだけで驚くほど正確な識別が可能です。このように、データ量の増加や、それを世界規模で共有できるようになったことなど、技術的な成功は数多くあります。 

博士課程在学中、幸運にもモデムを借りることができました。それは大きな木箱で、電話機の受話器を差し込んで固定し、別のコンピュータに情報を送信するものでした。今では私たちは情報を簡単に共有できるデジタル世界に生きており、技術は確かに大きく進歩しました。しかし、科学者や科学管理者がデータの重要性とその永続性について認識していないことが、依然として課題となっています。私は多くの価値あるデータベースプロジェクトが立ち上げられ、そして消えていくのを見てきました。膨大なエネルギーと労力がデータベースの構築に注ぎ込まれますが、資金が尽きると、5年後にはそのデータベースはもう見えなくなってしまいます。キュー植物園の同僚たちに、私は植物標本室に入って1880年に園長が書いた手紙を読み、彼が何を言っていたのかを知ることができるのに、10年前に同僚がデータベースに構築したデータにはアクセスできない、なぜならその技術はもはや利用できないからだ、と話しています。彼らはデータをエンコードしており、そのコードを知っているのは彼らだけなのです。プロジェクトでデータベースを構築する際には、その将来像を必ず把握しておくべきです。メタデータを組み込む必要があるのは、データを標本と同じように扱うことはできないからです。データ管理を怠ることは、世界にとって大きな損失であると、私は強く確信しています。 

あなたの現在最もエキサイティングなプロジェクトの一つは、近日公開予定の 健康のための植物 ポータルについてお聞かせいただけますか？それは一体何なのか、なぜ作成されたのか、そしてどのような問題を解決しようとしているのか教えていただけますか？ 

健康のための植物 これは単なるウェブサイト以上のものです。ウェブサイトはプロジェクトの成果物の一つです。例えば、同じデータセットに基づいて構築されたデータサービスを提供し、情報をさまざまな方法で提示しています。これは、キューで14年間運用されている追加の植物名サービスという以前のプロジェクトを基盤としており、私たちはそれをゼロから始めました。キューでしかこれができなかったのは、キューの分類学および命名法のリソースに基づいているからです。 国際植物名索引（IPNI）; ザ・ 世界維管束植物チェックリスト（WCVP）; インデックスファンゴラム、および 菌類菌類それらはまさに私たちの活動の中核を成すものです！ 

これらは、デジタル化プロジェクトから、古い薬草書に保管されている情報へのアクセス提供まで、キューにおけるすべてのデータ管理の中核を成すものであり、その情報は、次のようなグローバルなリソースを通じて共有されます。 ワールドフローラオンライン or 地球規模生物多様性情報機構 （GBIF）。これらのコアデータ、つまり学名とその同義語、そしてそれらが階層構造の中でどのように位置づけられるかは、他の分野で働く人々にとっても同様に重要ですが、彼らはこれらのリソースの存在を知りません。彼らはIPNIとWCVPの違いを知りません。彼らはIPNIにアクセスして同義語に関する情報が得られると期待しますが、IPNIはそのような目的で設計されていないため、それは得られません。彼らは科学的な命名法を正しく使用する方法を知りません。私が他の分野と言っているのは、生態学者、林業家、農村開発、医療専門家などを指します。

薬用植物名サービス （MPNS）そして今 健康のための植物は、植物や菌類由来の天然製品を取り扱う医療従事者を明確にターゲットとしています。私たちはこれらの種の百科事典ではありません。私たちは、他の人のデータを検索・参照するためのツールであり、インデックスです。 

私たちは、それらの出版物で使用されている学名と、一般名、医薬品名、薬学名（多くの場合、薬局方からラテン語で表記されている）を収集しました。生薬の名称は完全に曖昧な場合があります。たとえば、「高麗人参」を検索すると、タイトルに「高麗人参」を含む名前で販売されている生薬製品が多数あり、それらは100万以上の文献に由来していることがわかります。 26種類の植物 化学組成や用途が異なるため、消費者、規制当局、研究者にとって非常に混乱を招きます。科学文献には、科学的な命名法を正しく理解していないために、実際にどの植物を対象としていたのかが不明瞭な化学研究論文が多数掲載されています。そこで私たちの出番となるのです。

私たちは植物学の知識と医療用途の間のギャップを埋めようとしています。Plants for Healthでは、私たちの活動範囲ははるかに広くなっています。食品サプリメント、栄養補助食品、新しい食品、パーソナルケア製品、そしてより幅広い層に関連する菌類も対象に含めています。昨年、 MPNS 初めて100万人の同時アクセスを達成しました。キューガーデンで2番目にアクセス数の多いウェブサイトなので、これは大きな成果だと感じています。 

その影響は、研究と規制の強化にあります。 MPNSポータル 「高麗人参」については、 26種類の代替植物これらの植物をどれでも検索し、25種類ある学名のいずれかを使ってPubMedで公開されているすべての情報を取得できます。すべてのデータを見つけるには、すべての学名を知る必要があります。MPNSはそれを実現します。Plants for Healthポータルを使用すると、PubChem、PubMed、または当社と協力している他の多くのデータセットや共同研究者からデータを抽出できます。当社は、すべての情報を自社で保存することなく、さまざまな情報源から情報を提供できます。当社が提供するのは、情報へのアクセスです。

薬用植物、ハーブ療法、植物由来の健康製品に関する情報はオンライン上に膨大にありますが、その質は大きく異なります。 健康のための植物 証拠と信頼性へのアプローチ？

これはまさに人それぞれだと思います。私自身、科学的な真実をどのように定義づけるべきか、明確な答えを見出せていません。科学的証拠を強く求める風潮には、次第に抵抗を感じるようになってきました。とはいえ、証拠が重要でないと言っているわけではありません。私は科学者ですから、実際に効果があるのか​​、そしてどのように効果があるのか​​を示す証拠が必要だと考えています。 

私が言いたいことを説明すると、1900年には ブラジル薬局方 当初は、約100種類の植物から抽出された生薬がブラジル薬局方に掲載されていました。しかし、数十年の間にその数は減り続け、1980年代にはわずか8種類ほどにまで減少しました。その理由は、薬剤師たちが科学的根拠のレベルをますます重視するようになったためです。彼らは、科学的根拠が不十分な植物を掲載することに抵抗を感じていました。それ以降、ブラジル薬局方に掲載される植物の数は増加し始め、掲載された植物は主に中国やヨーロッパの植物でした。これは、これらの植物が中国やヨーロッパの研究室で十分に研究されていたためです。 

ブラジルでは、中国薬はブラジル薬局方にも掲載されており、十分な研究に基づいているため、店頭で容易に入手できます。しかし、研究が不十分な伝統薬はブラジル薬局方には掲載されません。そのため、善意で薬用植物を配った人が、薬効があるどころか毒性のある植物を配ってしまうという事態が生じます。こうした植物の利用方法を改善するために、私たちにできる簡単なことがいくつかあります。私はブラジルで素晴らしい化学者、フランシスコ・ホセ・デ・アブレウ・マトス氏と仕事をしたことがあり、彼は「リビング・ファーマシーズ」というプロジェクトに取り組んでいました。 ファルマシア・ヴィヴァ彼らは植物の有効性と安全性を検証し、有益な植物の利用を促進していました。人々に植物の栽培方法や、それらから石鹸やお茶を作る方法を教え、地域の人々がそれらの製品を自分たちで利用できるだけでなく、販売することで収入を得ることもできるようにしていました。私たちが到着する前から彼らはこうした活動を行っていましたが、私たちはプロジェクトに投入された科学的知識の一部を拡大し、強化することができました。ですから、科学は化学にこだわりすぎなくても、非常にシンプルなことを実現できるのだと思います。

データベースを構築するにあたり、私たちは自分たちが真実の源ではないことを明確にしようと努めています。ポータルの設計において私たちが直面する課題の一つは、それをユーザーにどのように伝えるかということです。ユーザーは私たちが真実を提供してくれると期待するかもしれませんが、私たちができるのは信頼できる文献や規制に記録されている情報を報告することだけです。法律の中で学名が誤って綴られている場合、私たちはそれを記録しています。植物学者の同僚たちはそれが間違っていることに憤慨しますが、その名前は法律で使用されており、今後も使用され続けるでしょう。正しい名前を人々に知らせるために、私たちはそれを記載する必要があります。ある植物が有毒であると述べている出版物と、その植物が有毒ではないと述べている別の出版物からの引用を掲載しています。矛盾する意見をユーザーに提示することで、ユーザー自身が判断を下せるようにしています。

私たちは、研究を容易にするために、マッピングツールに従って情報をインデックス化しています。ある植物の根を使ってマラリアを治療する方法を知りたい場合、私たちのデータベースを検索できますが、私たちが収集したすべての書籍、参考資料、規制に「マラリア」や「根」という単語が必ずしも使われているとは限りません。私たちがユーザーに提供するのは、元の出版物に含まれていた正確なフレーズとともに、簡略化された用語構造です。ある出版物ではこの植物は有毒であると述べ、別の出版物では無毒であると述べている場合、私たちは両方の証拠を並べて提示します。なぜなら、実際には毒性は非常に複雑だからです。私たちは、入手可能な情報を公開し、ユーザーがそれを探索して独自の結論に達することができるようにしたいだけです。私たちは一般名を削除しません。なぜなら、それらは言語の一部だからです。それらは人々の文化の一部です。一般名が間違っていると人に言うことは絶対にできません。私の祖母がブルーベルと呼んでいたものは、スコットランドではブルーベルではありません。

ユーザーからのフィードバックは、グローバルな植物データベースにどのような形で反映されるべきでしょうか？

それは、あなたの目的とデータベースの範囲によって大きく異なります。 フィードバックを求める 何が問題なのか、どの情報源がユーザーの業界にとって重要で、データベースに不足しているのかについて、私たちはパートナーと緊密に連携し、彼らの研究を検証し、充実させています。たとえば、英国に留学中のインドネシア人博士課程学生は、インドネシアで使用されている薬用植物の27,000もの異なる学名からなる膨大なデータセットを収集しました。私たちの役割は、彼女がそれらを整理するのを手伝うことでした。重複、スペルミス、同義語を削除し、最終的に約6,500種のリストを作成しました。彼女は、同じ植物を異なる名前で5回も調べる必要がなくなり、6,500種に保全活動を集中させることができました。私たちは、サービスを利用するすべての人に対して同じことを行います。 健康のための植物 データセットの強化、意思決定の強化、研究の強化など、さまざまなパートナー活動において、それは良いことだと感じます。 

小規模な国内植物標本館は、グローバルデータベースが依拠する植物、人々、そして景観に最も近い場所に位置することが多い。グローバルなデジタルリソースは、国や地方の標本館をより良く支援し、その功績を称え、そこから学ぶために、どのような方法を取るべきだろうか？

言語と地域知識に関して、いくつか明白な点があります。ブラジルには、それらの植物をよく知っている素晴らしい分類学者がたくさんいるのに、なぜブラジルの植物に焦点を当てる必要があるのでしょうか？キューガーデンが一体何をもたらすことができるのでしょうか？問題は、グローバルな広がりというよりも、学問分野の変化です。私がブラジル北東部で働いていたとき、国際開発省（DFID）が定期的に検査を行い、納税者の​​お金が正しく使われているかを確認していました。定期的に来ていたコンサルタントの一人は、ITと知識管理のとても感じの良い人で、私に「Mind the Gap」Tシャツをプレゼントしてくれました。私は彼が何を言いたいのか正確に理解していました。そのプロジェクトが始まると、誰もが「ボブ、ブラジルとイギリス間のコミュニケーションをどうやって管理するつもりですか？これは本当に難しいでしょう」と言いましたが、全く難しくありませんでした！イギリスの分類学者はブラジルの分類学者と同じ言語を話します。彼らは同じ信念体系を持っていました。彼らは同じ用語を使って会話しました。英国の農村開発専門家とブラジルの農村開発専門家は、互いに円滑に意思疎通を図ることができる。何の問題もない。しかし、分類学者と農村開発専門家が話し合い、互いを理解し、何が重要かについて合意しようとすると、そこで問題が生じるのだ。 

大切なのは、植物学と自然保護という私たちの小さな世界から、実際に植物を扱っている人々に手を差し伸べ、彼らの認識、特にどのような情報が必要なのかを理解することです。そして、私たちは時として、他の人々が植物をどのように扱っているのか、なぜ植物が必要なのかといったことへの好奇心が欠けているように思います。私たちは重要なことにばかり焦点を当ててしまいがちで、それでは情報管理の面で何の役にも立たないのではないでしょうか。

今後を見据えて、応用植物学データの未来について、最も期待していることは何ですか？

重要なのは、相互運用性の向上と、それがもたらすグローバルかつ分野横断的なデータ連携の可能性だと思います。そこにこそ真のチャンスがあり、キュー植物園のような、植物や菌類に関する標準的な用語を提供する組織にとって、植物や菌類について議論する必要はあるものの、その目的は全く異なるネットワークに参加できる素晴らしい機会がたくさんあります。しかも、そうしたネットワークの参加者はキュー植物園の存在すら知らないかもしれません。もちろん技術は必要ですが、AIが画期的な新技術を生み出すとは期待していません。本当に刺激的なのは、私たち全員がグローバルな情報ネットワークの一員となることなのです。

次に会う名前

次に高麗人参茶を淹れるときは、少し立ち止まって考えてみてください。あなたは自分が本当に飲んでいる植物の種類を知っていますか？

カモミールティー、ラベンダーオイル、「睡眠」ブレンド、ハーブサプリメント、あるいはスキンケア製品に含まれる植物由来成分についても、同じ疑問が投げかけられるでしょう。馴染みのある植物の名前は、単一の種、複数の可能性のある種、植物の部位、製品、地域の伝統、あるいは時間の経過とともに変化した名前を指し示す可能性があります。

デジタル植物学は、まさにこうした技術的な取り組み以上の意味を持ちます。単に標本コレクションをオンライン化するだけではありません。科学、医学、自然保護、貿易、政策、農業、園芸、そして日常生活の間で、植物に関する知識がより安全に共有されるように支援することが重要なのです。データベース、標本棚、野帳、規制、製品ラベル、あるいは誰かの記憶の中に、すでに問題を解決できる植物に関する知識が眠っているかもしれません。次の課題は、それらを繋ぎ合わせることです。

ゲストライタープロフィール

マグダ（彼女）は、イギリスとポーランドの国籍を持つ生態学者で、現在はイギリスのロンドンを拠点に活動している。野外生態学者としての訓練を受けた後、2023年に植物標本のデジタル化とキュレーションへと転身した。キュー王立植物園、南ロンドン植物研究所を経て、この秋にはダブリンのトリニティ・カレッジに加わる予定である。

表紙画像：ブラジルの市場で植物材料を見ているフランシスコ・ホセ・デ・アブレウ・マトス教授とヴァネッサ・セケイラ。出典：ボブ・オールキン