熱帯被子植物ショウガ目は、白亜紀に急速な放散を経験したと考えられる約2500種を含む、8つの熱帯単子葉植物科からなるクレード（系統群）で構成されています。ショウガ目は花の形態に大きな多様性を示し、ショウガ、カルダモン、ウコン、ガランガル、バナナ、オオバコなど、生態学的にも経済的にも重要な植物種もいくつか含まれています。ショウガ目の主要な系統間の深い系統関係は、これまでの研究で解明が困難であることが判明しており、単子葉植物の系統樹における重要な不確実性領域となっています。ショウガ目は8つの科からなる多様なクレードで構成されていますが、それぞれの科間の深い系統関係はほとんど解明されていません。
最近の Annals of Botany 次世代シーケンシングを使用して完全なプラスチド遺伝子セットを生成し、プラスチドゲノムは多くの関係を強力にサポートしますが、Heliconiaceae 目を含めることについては弱いサポートしか提供しないことを発見しました。さまざまなデータマトリックスプロパティの操作は、予測できない方法でツリートポロジーに影響を及ぼします。これは、プラストームの完全なコーディング領域では、この急速で古代の放散を解決するのに十分な特性情報が提供されないことを示唆しています。
