今週のBlueskyで最も共有されたアイテムのまとめです。今週はイライラする週でした。論文を探すのが難しいからではなく、その逆です。きちんと読んで記事を書きたい論文がたくさんあります。しかし、リストには載らなかったものの興味深い論文もたくさんありました。金曜日だけで1週間忙しくなりそうなほどの論文が届きました。どういうわけか、夏は静かになると思っていたのですが。いつものように、有料の論文には💰マークが付いています。それ以外の場合は、チェック時点で無料でアクセスできます。
この仕組み
私たちは、 ボタニーオート 論文へのリンクを含む項目を一覧表示して抽出します。論文について記事が書かれるたびに4ポイント、再投稿で3ポイント、いいねで1ポイントが加算されます。
植物学に関する投稿(論文へのリンクに限らず)を20%以上の頻度で行っている方を、植物学関連の自動投稿リストに追加するようにしています。リスト全体が植物に興味を持っているため、こうした内容が上位に表示される傾向があると考えています。
Botany Autoのリストに載っているべきなのに載っていない場合は、以下のメッセージを送ってください。 @botany.one ブルースカイで。
1. 植物の陸上化の起源における単一の遺伝子革新
Mbadinga Zamar, DL 他 bioRxiv · Blueskyに関する投稿2件 · いいね61件 · 再投稿37件
4億5000万年前に植物が初めて陸上に進出することを可能にした機能的な革新がどのように進化してきたのかは、依然として謎に包まれています。本研究では、単一の酵素ファミリーの獲得が、これらの革新のうち2つ、すなわち植物を脱水や紫外線から守るクチクラ層と、水分と栄養素の吸収を促進するアーバスキュラー菌根共生の進化において極めて重要な役割を果たしたことを示します。
メラニー・リッチ 🌱🍄 @melaniekrich.bsky.social · Bluesky
新しいプレプリントのお知らせ!
www.biorxiv.org/content/10.6...
脂質、植物の陸上化、そして植物共生の起源に関する長年の探求の結論 1/7 🧵
@pierremarcdelaux.bsky.social @katharinamel1.bsky.social @tatiana-vernie.bsky.social @kellerjeanphd.bsky.social
2. 淡水沈水性維管束植物における光合成多様性の研究における技術と課題
Loew-Mendelson、E. et al. · 植物科学への応用 · Blueskyに関する投稿2件 · いいね29件 · 再投稿16件
水生植物の光合成の多様性は陸生植物に匹敵するが、その多様性を支える環境条件は根本的に異なる。こうした環境の違いにもかかわらず、水生植物と陸生植物は炭素濃縮機構(CCM)を収斂進化させてきた。しかし、水生環境における方法論的な制約のため、水没植物におけるこれらの経路の特性評価は陸生植物に比べて遅れている。本稿では、水生植物におけるCCMを検出するための最新の方法を概説し、評価する。ガス交換や同位体分析などの生理学的方法は、陸生植物に関する貴重な知見を提供するが、水生システムでは大きな課題に直面する。
カロリナ・ヘイドゥク @kheyduk.bsky.social · Bluesky
@ellliieee.bsky.social が主導し、@wickellomics.bsky.social、他の研究室メンバー、そして @li-corenv.bsky.social の皆さんの協力を得て、新しい研究論文を発表しました。テーマは「水生植物の光合成を研究するにはどうすればよいか?」です。実は、かなり難しいことが分かりました!レビューと方法論に関する論文を兼ねています。ぜひご覧ください! doi.org/10.1002/aps3...
Blueskyで見る →3. 細菌代謝産物が真菌の代謝を再構築し、菌糸から酵母への形態変化を引き起こす
バラトワジ、M. ら · 現在の生物学 · Blueskyの投稿1件 · いいね40件 · 再投稿13件
真菌は、環境に適応し定着するために細胞形態を変化させる。カンジダ・アルビカンスの場合、ヒトへの共生定着と病原性は、侵入性の菌糸と拡散性の酵母細胞との間の可逆的な切り替えに依存している。酵母から菌糸への遷移はよく理解されているが、菌糸から酵母への逆遷移については比較的ほとんど知られていない。菌糸から酵母への遷移を可視化および定量化するイメージングアッセイを開発することにより、細菌の天然物であるグラジオリンがこの遷移を促進することを示す。
アコス・T・コヴァチ @evolvedbiofilm.bsky.social · Blueskyにて
細菌代謝産物が真菌の代謝を再構築し、菌糸から酵母への形態変化を引き起こす
@currentbiology.bsky.social Manasa Bharathwaj @mbharathwaj.bsky.social 他 Ana Traven より
www.cell.com/current-biol...
4. 葉面塩水噴霧排除と組織耐性は、海洋塩水噴霧に対する局所的適応の根底にある。
プランカート、ML ら.· アメリカ植物誌 · Blueskyの投稿1件 · いいね33件 · 再投稿11件
沿岸生態系に生息する植物にとって、海水の塩水噴霧の影響を生き延びることは非常に重要ですが、沿岸植物の塩水噴霧に対する耐性メカニズムは十分に解明されていません。私たちは、沿岸および内陸の生息地に局所的に適応した、緯度が異なる5組のキバナオオバコの系統を比較することで、塩水噴霧への適応メカニズムを調査しました。私たちの結果は、沿岸生息地への植物の適応には、海水の塩水噴霧によるストレスを生き延びるための複数のメカニズムの進化がしばしば伴うことを示唆しています。
アメリカ植物学会 @botsocamerica.bsky.social · Blueskyにて
葉面塩水噴霧排除と組織耐性が海洋塩水噴霧に対する局所適応の根底にある
@madisonplunkert.bsky.social、@pcdurant.bsky.social、@davidlowry.bsky.social、およびKatherine Egelerによる#AJBの新たな研究
doi.org/10.1002/ajb2...
#植物学 #植物科学 #ミムラス #ミムラス
5. 形態形成調節因子BABY BOOMとGRF‐GIFの組み合わせは、トウモロコシの形質転換効率を向上させ、葉の再生を促進する。
チェン、Z. ら · New Phytologist · Blueskyの投稿1件 · いいね22件 · 再投稿13件
形質転換は、植物遺伝学および機能ゲノミクスにとって不可欠なツールです。トウモロコシにおける安定形質転換はもはや大きな障害ではありませんが、学術研究室にとってアクセスしやすく効率的な方法が依然として必要とされています。本稿では、B104およびその他のトウモロコシ系統における未熟胚の形質転換に最適化された、迅速かつ効率的なアプローチであるGGBシステムを紹介します。このシステムは、2つの異なる形態形成調節因子、コムギGRF4-GIF1キメラとトウモロコシBABY BOOM(BBM)転写因子(そのため「GGB」という名前が付けられました)を改良したQuickCornプロトコルと組み合わせることで、形質転換トウモロコシ植物体を約2か月で再生することを可能にし、その効率は、いずれかの形態形成因子を単独で使用した場合と比較して7倍高くなっています。
New Phytologist @newphyt.bsky.social · Blueskyにて
形態形成調節因子BABY BOOMとGRF-GIFの組み合わせは、トウモロコシの形質転換効率を向上させ、葉の再生を促進する。
???? nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/...
Chenらによる
@WileyPlantSci #植物科学
6. 多分野にわたる証拠に基づく、顕花植物ユキノシタにおける食虫性の特定
張、XJ ら · ネイチャー·コミュニケーションズ · Blueskyの投稿1件 · いいね25件 · 再投稿9件
捕食者から被食者への転換は、多様な動物を捕獲・消化して栄養素(窒素、N)を得る食虫植物すべてに共通する、驚くべき適応革新である。本稿では、高山性顕花植物であるユキノシタ(Saxifraga candelabrum、ユキノシタ科、ユキノシタ目)の食虫性について報告する。野外実験と標本調査により、この植物は腺毛を介して昆虫を積極的に誘引・捕獲することが明らかになった。
チェンシン・リー博士 @chenxinli2.bsky.social · Blueskyにて
またしても食虫植物の事例が発見されました。今回はユキノシタ属(Saxifraga)です。食虫性は、植物の間で繰り返し収斂進化してきた巧妙な能力の一つです。#植物科学
から: www.nature.com/articles/s41...
7. 熱波時の気孔の分離は、長期的な実験的干ばつ下におけるセイヨウヒイラギガシの葉の冷却や回復に影響を与えない
ゴーティ、A. 他 · 樹木生理学 · Blueskyの投稿1件 · いいね18件 · 再投稿11件
地中海沿岸の地域で葉の生理機能と樹冠温度を調査した。 セイヨウヒイラギ 20年以上にわたる実験的な降雨遮断にさらされた森林。これには、40℃を超える猛暑の時期も含まれる。全体として、 Q. モチノキ 極度の高温下では気孔の分離が見られたが、このメカニズムによる蒸発冷却効果は限定的で、樹冠の焼け焦げを防ぐことはできなかった。長期的な干ばつは、気孔分離そのものの発生よりも、むしろ回復能力に主に影響を与えた。
アリス・ゴーティ @a-gthy.bsky.social · Blueskyにて
🌳🌡️ 私たちの新しい論文が発表されました!極度の暑さの中で、成熟したセイヨウヒイラギガシの木で気孔の分離が起こることを示しましたが、このメカニズムは葉の冷却にはほとんど役立ちませんでした🍂
academic.oup.com/treephys/adv...
@charlottegrossiord.bsky.social
@mdekauwe.bsky.social
その他多数
8. 土壌コア微生物叢の再考
リー、J. 他 New Phytologist · Blueskyに関する投稿2件 · いいね14件 · 再投稿10件
コアマイクロバイオームという概念は、宿主関連研究から生まれ、明確に定義された空間的、時間的、生物学的境界を超えて保存されている微生物の構成員や機能を記述するために用いられてきました。しかし、土壌および植物関連マイクロバイオームの研究では、この用語は、研究固有の閾値や基準を用いて選択された分析的に定義されたサブセットへと次第に変化してきました。バイオエネルギー作物畑の土壌に関する最近の文献と複数地点での分析を統合することで、コアマイクロバイオームの本来の生物学的意味が、データセット固有の分析基準によって曖昧になっていることを示します。
New Phytologist @newphyt.bsky.social · Blueskyにて
✨ ペーパースポットライト ✨
(🧵 1/6) 土壌コア微生物叢の再考
nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/...
9. いもち病耐性向上を目的とした、オオムギNLRのExo70統合ドメインのエンジニアリング
サード、I. 他 植物細胞 · Blueskyの投稿1件 · いいね15件 · 再投稿10件
細胞内免疫受容体は、病原体由来のエフェクター分子を検出して応答することで、植物を微生物の侵入から保護し、多くの場合、細胞死反応を引き起こします。しかし、病原体のエフェクターは免疫認識を回避するように進化することがあり、その結果、世界の農業を脅かす壊滅的な病気が発生します。本研究では、オオムギの細胞内ヌクレオチド結合ロイシンリッチリピート(NLR)RGH2由来の統合されたExo70ドメインが、イネいもち病病原体のエフェクターAVR-Piiと、それと密接に関連するコムギいもち病を引き起こす変異体の両方と相互作用できることを示します。
植物細胞 @theplantcell.bsky.social · Blueskyにて
大麦NLRのExo70統合ドメインを工学的に操作して、いもち病抵抗性を向上させる(Indira Saado、Helen J Brabham、Josh W Bennett、Anson Ho Ching Lam、Inmaculada Hernández-Pinzón、Matthew J Moscou、Juan Carlos De la Concepcion、Mark J Banfield) doi.org/10.1093/plce... #植物科学 @aspbofficial
Blueskyで見る →10. 単一細胞オミクス技術を統合して、アーバスキュラー菌根共生の時空間的複雑性を解明する
フェレラス=ガルチョ、G., 総長、T., パシュコフスキー、U. · 実験植物学ジャーナル · Blueskyの投稿1件 · いいね17件 · 再投稿9件
本レビューでは、アーバスキュラー菌根共生(AMS)の時空間制御に関する現在の知見を概説し、既存の空間データセットのAMS研究への関連性を評価し、今後の研究のための新たな展望を提供する。
実験植物学ジャーナル @jxbotany.bsky.social · Blueskyにて
🧬🌱 レビュー 🌱🧬
Ferreras-Garruchoらは、単一細胞技術における最近の方法論的進歩を探求し、細胞型特異的な植物および菌類のトランスクリプトームに焦点を当て、アーバスキュラー菌根共生の時空間ダイナミクスを解明する。
🔗 doi.org/10.1093/jxb/...
#植物科学 🧪
11. 三畳紀末期の森林の消失に伴う、日和見的なヒカゲノカズラ類の世界的増殖
Peng, J. 他 npj 古生態系 · Blueskyの投稿1件 · いいね21件 · 再投稿7件
陸上における環境危機や大量絶滅事象の後には、通常、生態系の激変が起こり、その間に日和見的な植物が荒廃した景観に急速に定着し、複雑な森林生態系の確立に先立つ一時的な「先駆」群落を形成します。本稿では、約2億100万年前の三畳紀末の大量絶滅事象の後に、このようなパターンが見られることを明らかにします。スウェーデンの下部ジュラ紀(ヘッタンジアン期)の地層におけるプレウロメイア類ヒカゲノカズラ類の最後の世界的な出現を記録し、親植物であるLycostrobus scottiiとその大胞子および小胞子との間の生物学的つながりを示します。
12. 見えないものを見る:ハイパースペクトルイメージングが、根源経済学の領域に新たな窓を開く
レワルド、B. · New Phytologist · Blueskyの投稿1件 · いいね15件 · 再投稿8件
細根は植物の「隠れた半分」とも言える存在で、水分や栄養素の吸収・輸送を調節し、植物の資源利用戦略を支え、群集や生態系のプロセスに影響を与える。しかし、その生態学的な重要性にもかかわらず、根は葉や茎に比べて研究が著しく少ない。これは、方法論的な課題が一因となっている。
13. セイヨウカノコソウのゲノム配列解析により、バレレン酸生合成およびフラボノイド代謝に関わる候補遺伝子が明らかになった。
デ・オリベイラ、JAVS, バエズ、M., パッカー、B. · bioRxiv · Blueskyの投稿1件 · いいね14件 · 再投稿8件
バレリアナ・オフィシナリスはバレリアンの学名で、抗不安作用を持つ化合物であるバレレン酸を生成することで知られる植物です。不安障害は世界的な健康危機であり、人々の日常生活に影響を与えています。天然由来の非合成不安治療薬に対する世界的な需要が高まるにつれ、バレリアンは有望でありながら十分に活用されていない薬用資源として注目されています。そのゲノムを理解することは、バレレン酸生成に関わる生合成遺伝子を解明し、その生成に関するさらなる研究を促進するための第一歩となります。本稿では、アセンブリサイズ3.3 Gbp、N50値110.8 Mbpのバレリアンのゲノム配列と、96.6%の完全性を持つ対応するアノテーションを初めて報告し、バレリアンの特殊代謝の遺伝的基盤を研究するための基礎的なリソースを提供します。
14. 細菌の小型調節RNA ????
パペンフォート、K. · ネイチャーレビュー · Blueskyの投稿1件 · いいね21件 · 再投稿5件
本レビューでは、細菌のsRNAの調節機能を概説し、その発現と調節的影響を制御する分子メカニズムについて説明し、細菌におけるsRNAを介した遺伝子調節を取り巻く多くの興味深い未解決問題について議論する。
15. 集団ゲノミクスは、植物の選択と適応のダイナミクスについて、どのようなことを明らかにしてきたのだろうか?
ガウト、BS 他 分子生物学と進化 · Blueskyの投稿1件 · いいね10件 · 再投稿8件
集団ゲノミクスは、自然選択が植物ゲノムをどのように形成するかについての理解を大きく変えました。全ゲノム再配列データの爆発的な増加により、ゲノム全体にわたるヌクレオチド多様性の推定が可能になり、選択が組換えや個体群動態とどのように相互作用するかが明らかになり、推論の対象は作物やモデル種にとどまらず、事実上あらゆる植物システムにまで広がりました。本稿では、植物ゲノムに対する自然選択の作用に関する重要な教訓と未解決の課題をまとめます。
16. 部分的な菌従属栄養:アーバスキュラー菌根植物における一般的な戦略か?
メルクス、VSFT 他 New Phytologist · Blueskyの投稿1件 · いいね9件 · 再投稿8件
陸上植物の大部分は、光合成によって生成した有機炭素の一部を根細胞内のアーバスキュラー菌根菌(AM菌)に伝達します。菌類は、植物が土壌から栄養分と水分を吸収するのを助けます。この炭素は、同じ菌類ネットワークを利用する稀な非光合成性の「菌従属栄養植物」によって、菌根菌から獲得されることがあります。しかし、最近の研究では、一部の緑色植物にもAM菌からの炭素吸収が存在する可能性が示唆されています。もしそうであれば、これらの植物は純粋な独立栄養植物ではなく、部分的な菌従属栄養植物(混合栄養植物)に分類されることになります。本稿では、この特性の存在と普及に関する進化的、生態生理学的、形態学的、遺伝学的、および環境的証拠について考察します。
17. 植物の生物音響学:超音波放射の解読 ????
フォント・ボルデラ、P. 他 実験植物学ジャーナル · Blueskyの投稿1件 · いいね14件 · 再投稿6件
数十年にわたり、植物と環境の相互作用は主に化学的および視覚的刺激によって媒介されると考えられてきた。しかし、近年の研究により、植物生理学におけるこれまで十分に研究されてこなかった側面、すなわち空気中の超音波放射が明らかになった。本レビューでは、植物バイオアコースティクスに関する最新の研究を評価し、超音波の発生、特徴、および様々なストレス条件下における特異性に焦点を当てる。
18. 外来植物の菌根形成戦略は、生物群系や撹乱によって異なる。
カザニガ、SG 他 自然の生態と進化 · Blueskyの投稿1件 · いいね9件 · 再投稿7件
どの外来植物種がどこに定着するかを予測することは、生物多様性の保全と管理にとって極めて重要です。理論的には、外来植物の菌根戦略がその定着の成功を予測できると考えられています。本研究では、440,788の植生調査区画からなるグローバルデータセットと、植物の在来性および菌根の種類に関するデータを組み合わせ、外来植物の菌根戦略を評価します。
19. 種の関連性と環境反応を組み合わせることで、指標種の選定に役立つ情報を提供する
リッサネン、T. 他 エコロジーアプリケーション · Blueskyの投稿1件 · いいね14件 · 再投稿5件
生物多様性は前例のない速さで変化しており、効果的で拡張性のある生態学的モニタリングの必要性が強調されています。しかし、どの種をモニタリングするかを選択することは依然として大きな課題です。指標種は、より広範な生物多様性の傾向を費用対効果の高い方法で示すことができますが、気候、土地管理、およびそれらの相互作用によって形成される複雑で急速に変化する生態系全体で指標種を特定するための堅牢なデータ駆動型アプローチには重大なギャップがあります。私たちは、森林の生物多様性の重要な部分でありながら、樹木ほど継続的にモニタリングされていないことが多い北方林の林床群落をモニタリングするための潜在的な指標種を選択するモデルベースのアプローチを提供します。私たちは、複数の分類群との関連性から維管束植物に焦点を当てています。共同種分布モデルを使用して、フィンランド全土の種間および種と環境の関係を調査し、さまざまな土壌タイプと生物気候帯にわたる約3000の研究サイトをカバーする全国的な林床植生データと、気候、生息地、森林管理を表す主要な環境要因を利用します。
表紙画像: ゾステラ・ムエッレリ・ノヴァゼランディカ by ロイド・エスラー / iNaturalist BY-NC CC