サイエンスシェアード：10月3日

今週の選定論文の多くはbioRxivからのもので、無料で閲覧できます。査読はされていませんが、多くの人がプレプリントを共有しているということは、読む価値のある内容が含まれていると推測できます。いつものように、有料論文には💰マークが付いています。それ以外の論文は、確認時点では無料で閲覧できます。

1. NO VEINは、植物とウイルスの相互作用に関与する祖先的な免疫タンパク質である。
ラゲイデ、E. 他 bioRxiv · Blueskyに関する投稿2件 · いいね83件 · 再投稿48件

本稿では、シロイヌナズナにおける必須の発生的役割が以前に特徴づけられた植物タンパク質であるNO VEIN（NOV）が、細菌の抗ファージタンパク質であるTiamatとドメイン構成および構造的類似性を共有していることを示す。

2. 陸上植物におけるDELLAの発達と共生機能の段階的進化
メルコニアン、K. 他 New Phytologist · Blueskyに関する投稿2件 · いいね44件 · 再投稿33件

顕花植物では、DELLA（アスパラギン酸（D）、グルタミン酸（E）、ロイシン（L）、ロイシン（L）、アラニン（A）を含む保存されたアミノ酸モチーフにちなんで名付けられた）タンパク質は、ジベレリン不感受性、GA1-3抑制因子、およびスケアクロウ（GRAS）転写因子であり、植物ホルモンであるジベレリン（GA）によって媒介される複数の機能を果たします。

3. 気孔調節がない場合のミムラス・グッタトゥスの分布域全体における萎凋耐性の差異
ブランチ、HA 他 bioRxiv · Blueskyに関する投稿4件 · いいね56件 · 再投稿18件

表現型と環境がストレス下でのパフォーマンスを予測できるかどうかは、生態学と進化において極めて重要であり、地球規模の変化に対する種の脆弱性を明らかにすることができる。我々は、ミムラス・グッタトゥスを広範囲にわたってサンプリングし、生殖、形態、生理学的特性が干ばつへの反応を予測できるかどうかを検証した。驚くべきことに、水分バランスの重要な調節因子である気孔反応は、干ばつが激化しても変化しなかったことがわかった。

4. 大麦細胞表面受容体SRF3の標的化 ブルメリア・ホルデイ エフェクターAVR_A13 AVRと重複する_A13 MLAによる認識とNLRを介した細胞死の誘導。
Shi、W。 他 bioRxiv · Blueskyの投稿1件 · いいね26件 · 再投稿15件

病原体は、病原性を促進するためにエフェクタータンパク質を分泌します。オオムギのMla抵抗性遺伝子によって認識されるにもかかわらず、構造的に関連するBlumeria hordei（Bh）AVR aエフェクターはBhゲノム内に維持されており、真菌の病原性にとって重要な病原性機能を示唆しています。トランスジェニックオオムギで近接依存性タンパク質標識を使用して、構造的相同性とMLAへの収束にもかかわらず、5つのAVR Aについて異なる宿主タンパク質相互作用を検出しました。高度に保存されたAVR A13エフェクターとオオムギ細胞表面受容体SRF3との特異的な相互作用を報告します。AVR A13はHvSRF3-HvBAK1相互作用を阻害し、HvSRF3の細胞膜レベルを変化させます。

イザベル・サウル @izzysaurlab.bsky.social · Blueskyにて

原稿の大幅なアップデートを発表できることを嬉しく思います。 www.biorxiv.org/content/10.6...
@grandpahiro.bsky.social とのコラボレーションにより、
@sara-stolze.bsky.social、Matthieu Platre、Götz Hensel および Gunther Döhlemann のチームがそれを証明します….. (1/x)

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5. ゲノム変異と種間における花形質の適応との関連性
アコカ・ピドール、S., ウェシンガー、カリフォルニア州, ハイレマン、LC · New Phytologist · Blueskyに関する投稿2件 · いいね21件 · 再投稿15件

本レビューでは、定量的遺伝学的観点から、花形質の分化の遺伝的構造が特定の送粉システムへの適応にどのように依存するのか、また、分化過程における花形質の集合の動態にどのような影響を与えるのかを考察する。近縁種における分化した花形質をマッピングした研究結果を概観した後、形質マッピング手法と、種の境界を区別するゲノム変異を特定する手法を組み合わせることの重要性を強調する。

New Phytologist @newphyt.bsky.social · Blueskyにて

ゲノム変異と種間における花形質の適応との関連性

#TansleyReview by Acoca-Pidolle et al. @carriewessi.bsky.social

nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/...

#植物科学

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6. 合成FLS2受容体オリゴマーは植物の自然免疫を増強する
Ma、Z。 他 科学の進歩 · Blueskyの投稿1件 · いいね23件 · 再投稿14件

細胞表面受容体の段階的な集合とオリゴマー化は、免疫活性化とターンオーバーの調節に不可欠である。しかし、動的な会合の複雑さゆえに、動的で時空間的に制御された集合が植物の自然免疫における迅速かつ持続的なシグナル伝達をどのように可能にするのかは依然として不明である。我々は合成工学的手法を用いて、シロイヌナズナFLS2受容体のオリゴマー化状態を精密に制御した。

7. イネいもち病菌はイネのRALFペプチドを乗っ取って感染を開始する
深田、F. 他 bioRxiv · Blueskyの投稿1件 · いいね22件 · 再投稿13件

植物由来のペプチドは免疫と宿主と微生物の相互作用を調節するが、真菌病原体が感染部位の選択に内因性の植物ペプチドを利用するかどうかはほとんど不明である。迅速アルカリ化因子（RALF）は、植物の発達、生殖、ストレス応答、細胞壁組織化に寄与する植物ペプチドホルモンのファミリーである。本研究では、イネ（Oryza sativa）の免疫活性化ペプチドであるOsRALF7が、宿主侵入に必要な特殊な感染構造である付着器形成の宿主由来のシグナルとしてイネいもち病菌Magnaporthe oryzaeに利用されていることを示す。合成OsRALF7ペプチドはイネ懸濁培養細胞で防御応答を誘導したが、同じペプチドはM. oryzaeで付着器形成を誘導した。

8. CBS-toolsを用いたゲノムアセンブリにおける性染色体の同定、フェージング、および構造的注釈付け
ウィット、L. 他 bioRxiv · Blueskyの投稿1件 · いいね20件 · 再投稿12件

染色体によって性別が決定されている種の完全な参照ゲノムには、すべての性染色体相同体の足場が含まれている必要があります。しかし、性染色体は常染色体とは異なる計算上の課題を抱えています。ここでは、性別が特定されたいくつかの分離株の全ゲノムシーケンスを利用したk-merベースの解析、Cytogenetics-By-Sequencing (CBS) ツールを紹介します。通常、性染色体の1つの側面のみを扱う他のアプローチとは異なり、CBS ツールは、異型配偶子を持つ性別の発見から性決定領域 (SDR) の特定まで、ユーザーをガイドすることを目指しています。

9. シロイヌナズナの新倍数体における染色体切断は、古代のゲノム再編成と共局在する候補脆弱部位で優先的に発生する。
スリカント、T. 他 bioRxiv · Blueskyの投稿1件 · いいね22件 · 再投稿9件

新たに形成された倍数体は、しばしば広範な異数性と染色体再編成に見舞われる。我々は、これらが予測可能であり、遺伝子型間で保存されているかどうかを検討した。2つの系統（Col-0とL er）由来の新倍数体シロイヌナズナの子孫アレイにおける全染色体および部分的な異数性を定量化した。子孫の29%が全染色体および／または部分的な異数性を示した。驚くべきことに、部分的な異数性はL erからのみ発生し、特に母方から発生していたことから、遺伝子型と起源の性別が重要であることが示された。

植物の進化 🌱🌾 @plantevolution.bsky.social · Blueskyにて

@thanvisrikant.bsky.social と @kbomblies.bsky.social による素晴らしい新研究：#Arabidopsis thaliana の新倍数体染色体は、古代のゲノム再編成に対応する脆弱部位で優先的に切断される。
#植物科学
www.biorxiv.org/content/10.6...

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10. 母植物が火にさらされると、子孫の発芽が促進される
ゲグンデ、J., カステリャノス、MC, パウサス、JG · エコロジー · Blueskyの投稿1件 · いいね19件 · 再投稿7件

火災後に再生する植物は、火災後の環境で劇的に変化する条件を経験します。しかし、火災への植物の曝露が子孫の形質に及ぼす影響は、まだ十分に研究されていません。再生する種の多くは、火災後に急速に開花および結実する草本植物（火災刺激開花）であり、資源利用可能性の増加と生物間の相互作用の変化、特に受粉の強化の下で種子を発達させます。私たちは、これらの変化が母体からの供給と花の訪問と花粉の付着の質の向上を通じて、子孫の初期発達を改善する可能性があると仮説を立てました。これを検証するために、地中海の3つの地中植物（Asphodelus cerasifer、Drimia maritima、Narcissus assoanus）を選択し、火災後の最初の結実期に、ペアになった焼失植物と隣接する非焼失植物の間で種子質量（3161個の種子）と総発芽数（2262個の種子）を比較し、4年間で6つの集団をサンプリングしました。

11. 塩ストレス下での動的な分泌タンパク質群を追跡するための、TurboIDベースの近接標識ツールの開発 ????
Lin, D. 他 New Phytologist · Blueskyの投稿1件 · いいね19件 · 再投稿7件

分泌タンパク質は植物の発達と環境適応に不可欠ですが、アポプラスト分泌タンパク質群には複数の分泌経路由来のタンパク質が含まれているため、従来の小胞体（ER）-ゴルジ体経路を介して輸送されるタンパク質を選択的にプロファイリングすることは技術的に困難です。そこで私たちは、シロイヌナズナにおいて従来の分泌経路に入るタンパク質を選択的に濃縮するために、ERアンカー型TurboID近接標識法を開発しました。

12. 北米東部産ヒポキシス属植物の種子図鑑 ????
Zona, S. 他 トーリー植物学会誌 · Blueskyの投稿1件 · いいね27件 · 再投稿4件

6種の種子の微細形態 ヒポキシス 北米東部（テキサス州以東）に生息するヒポキシス科の植物を、低真空走査型電子顕微鏡（後方散乱検出器付き）を用いて研究した。種皮の細胞の形状とクチクラの構造は、特定の種に特徴的なものであるように見えた。

13. 花びらから金属へ：植物標本のための大規模な季節現象ラベル付けの自動化への長い道のり
グラディ、EL 他 植物科学への応用 · Blueskyの投稿1件 · いいね19件 · 再投稿6件

本稿では、アンサンブルモデリング手法を用いて植物標本上の花を検出し、そのデータを植物季節学研究コミュニティに提供する機械学習パイプラインを紹介する。トレーニングデータ生成のための複数の戦略をテストした結果、社内の専門家によるキュレーション済みの注釈が、信頼性の高い結果を得るために不可欠であることがわかった。

14. アボカドの未熟果実の脱落は、種皮のホルモン変化によって引き起こされる。
ハーバーマン、A. 他 実験植物学ジャーナル · Blueskyの投稿1件 · いいね7件 · 再投稿7件

本研究では、落果する運命にある果実が、樹木から分離して縮む前に成長停止を起こすことを明らかにした。比較RNAシーケンス解析の結果、成長停止は、まず種皮で開始され、その後果皮と胚に伝達される転写産物の再プログラミングと関連していることが示された。遺伝子発現およびホルモンプロファイリングの結果から、果実の成長停止は、種皮におけるオーキシン活性の低下と、エチレン前駆体であるアブシジン酸、1-アミノシクロプロパン-1-カルボン酸、および生物活性ジャスモン酸であるジャスモノイルイソロイシンの増加と関連していることが示された。

15. 高解像度顕微鏡による植物細胞全体の観察により、ウイルスによって引き起こされる細胞間結合の変化が明らかになった。
レーガン、BC州 他 bioRxiv · Blueskyの投稿1件 · いいね15件 · 再投稿4件

原形質連絡（PD）は、植物ウイルスが細胞間を直接伝播するための経路を提供する。ウイルス感染はPDを介した細胞間輸送を増加させる（ゲーティングと呼ばれる）が、そのメカニズムは不明である。本研究では、高解像度体積電子顕微鏡と生細胞イメージングを組み合わせることで、様々なウイルスが感染した葉のPD数を増加させることを明らかにしました。

16. ESCRT-IサブユニットVPS37-1およびVPS28-2の異なるユビキチン修飾は植物の免疫を正に制御する
王、C。 他 New Phytologist · Blueskyに関する投稿2件 · いいね9件 · 再投稿4件

本研究では、XBAT35.2がESCRT-I複合体の2つの主要構成要素であるVPS37-1とVPS28-2と生体内で相互作用することを明らかにしました。XBAT35.2はVPS37-1をK48結合ポリユビキチン鎖でユビキチン化し、プロテアソーム分解を誘導します。また、VPS28-2をK63結合鎖で修飾し、FLS2との相互作用を減少させます。

17. 氷河期から現在まで：世界最古の針葉樹林におけるクローン増殖と遺伝的変異 ????
マーシック、JR 他 アメリカ植物誌 · Blueskyの投稿1件 · いいね6件 · 再投稿6件

植物の間ではクローン性が広く見られるが、最も古いクローン内の遺伝的多様性を支配するプロセスについては、まだ十分に研究されていない。我々は、世界で最も長寿な樹種の一つである、タスマニア州西部のマウント・リードにある古固有種の針葉樹、ラガロストロボス・フランクリンイの、樹齢1万500年とされるクローン群落を用いて、これらの動態を調査した。

18. 受容体とリガンドの相互作用の理解と設計
ドブラス、VG 他 植物誌 · Blueskyの投稿1件 · いいね9件 · 再投稿5件

本特集号では、受容体とリガンドの相互作用における新たなテーマや注目されているテーマ、そして古典的な受容体経路に関する新たな知見に焦点を当てた、時宜を得た一連のレビュー論文が掲載されています。受容体機能の分子メカニズムを理解することで、認識およびシグナル伝達ネットワークの設計が可能になります。

19. 単一核RNAシーケンスにより、トリコームの発生経路と転写制御ネットワークが明らかになる。
クソニンジン
Lv、Z。 他 実験植物学ジャーナル · Blueskyの投稿1件 · いいね10件 · 再投稿4件

ヨモギ（Artemisia annua）は腺毛にアルテミシニンを生成・蓄積するが、その腺毛発達の分子メカニズムは未だ十分に解明されていない。本研究では、生後10日のヨモギ実生の単一核RNAシーケンス解析を行い、葉の腺毛細胞における特異的なRNA発現を明らかにした。

20. 硝酸塩は、発達中の木部における転写を一時的に再配線する。 ハコヤナギ CRF4を介して細胞増殖を促進する木材
チョードリー、S. 他 植物細胞 · Blueskyに関する投稿2件 · いいね5件 · 再投稿4件

硝酸塩は栄養素とシグナル伝達分子の両方の機能を持つが、硝酸塩が木質組織内でどのように認識され、発生的な出力に変換されるのかは不明である。本研究では、ハイブリッドポプラ（Populus tremula × P. tremuloides）の発達中の木部が、硝酸塩に対して細胞型特異的な迅速な転写応答を示し、木部細胞の伸長を促進することを明らかにした。

表紙画像：クリップアート。